第一幕，大都。
张无忌带着明教教众去大都营救六大派，范遥现身相认，并告知张无忌一些讯息。
万安寺中，灭绝师太把峨眉派教主之位传给周芷若，告诉她倚天屠龙的秘密，并且让她发誓不许嫁给张无忌。
王保保率军镇守万安寺，并在里面设下重重机关，明教教众伤亡惨重。
张无忌大发神威，打退护卫，劫持王保保。
赵敏出现，下令焚烧万安寺塔，要把六大派的人烧死。
张无忌以乾坤大挪移救下跳楼的六大派弟子，灭绝师太不想被张无忌所救，把周芷若从楼上推了下去。
张无忌从下面接住周芷若，灭绝师太和鹤笔翁大战，两人从楼下掉下来。张无忌想到昔日一掌之仇，一掌把鹤笔翁打进大火中烧死。
灭绝师太不愿接受施恩，推了张无忌一掌，自己当场摔死。
赵敏率军围住万安寺，为了救王兄，不得不放明教教众和六大派弟子离开。
赵敏办事不力，被汝阳王禁足，并夺了手中的权力。
曾经张无忌为救俞岱岩和殷梨亭，索要黑玉断续膏，答应赵敏三个条件。
赵敏的第一个条件，便是借屠龙宝刀一观。
赵敏失势，失意独饮，张无忌赴约，想要完成曾经的许诺。
张无忌要求赵敏跟他一块去冰火岛见谢逊，屠龙刀就在那里。
峨眉派弟子下葬灭绝师太，丁敏君向周芷若发难，意在掌门之位。张无忌救下周芷若，带着她一起去冰火岛。
第二幕，冰火岛。
张无忌携三美去冰火岛，得知谢逊和屠龙刀的消息非常惊讶。周芷若眼神闪烁，暗暗谋划。小昭偷偷把消息，送给波斯明教总教。
紫衫龙王提前一步抵达冰火岛，囚禁谢逊，夺走了屠龙刀。
风云月三使武功诡异，张无忌占下风，以乾坤大挪移夺走圣火令。
小昭心怀愧疚，告诉圣火令的秘密。原来圣火令一共有三枚，其中一枚阴差阳错到了波斯明教，另外两枚在中土明教。
一枚由教主掌握，随着阳顶天逝世，下落不明。
最后一枚在一个神秘的地方，只有历代教主知道。
小昭帮张无忌翻