他先是想全部赦免董卓的部下，吕布也多次相劝，可继而王允又对群臣解释说：“本来，他们是没有罪的，只是身不由己，跟随董卓，所以不得已听从董卓差遣，犯了错误。
现在如果给他们突然加上恶逆的罪名，而且特定赦免他们，恐怕反而使他们猜疑恐惧，心理承受不了，所以，赦免他们无罪不是使他们安心之上策，还不如让他们承受惩罚。”
吕布又想把董卓的财物赏赐公卿、将校，王允又不准。
王允平日看不起吕布，以剑客对待他。
吕布也认为自己有功劳，自吹自擂，既不得意，渐渐与王允不和了。
凉州兵是董卓的嫡系部队，战斗力强，而且对董卓最忠心。董卓死后，如何处置凉州兵，是关系王允本人和东汉政权的大事。
王允企图削夺凉州兵将领的兵权，取缔全部凉州兵，并且计划利用关东兵去控制他们。
可是后来有人对王允说：“凉州兵素来害怕袁绍，畏惧关东兵，而今，如果选择解兵，凉州兵人人都会担心性命不保，可以任命皇甫嵩（字义真）为将军，去担任凉州兵的统帅，并让他长期留在陕县，以便安抚军心。”
王允坚决反对：“这样绝对不行，关东兵是反董卓的义兵，与我们是同一条路线，现在董卓已死，如果继续把他们屯驻在险恶之地，虽然安抚了凉州兵，但是关东兵将领会疑心我们不重视他们。”
董卓部将李傕、郭汜等为董卓报仇，在长安杀了王允的全家。
王凌和哥哥王晨当时年龄尚小，翻过城墙逃出，跑回太原。
早年就和司马懿的哥哥司马朗，贾逵等人结为好友，后来举孝廉出身，出任发干县（今山东省冠县）县令，后因罪获刑。
服刑期间，恰逢兖州刺史曹操巡察。
曹操得知他是王允的侄子，又系因公犯罪，当即解除他的劳役，委以骁骑将军主薄之职。
及中山太守，有治绩，后来得到受曹操赏识，出任丞相掾属。
黄初元年（220年），曹丕称帝后，王凌任散骑常侍，出任兖州刺史。
黄初三年（222年），参与洞口之战。