“及在际会，每乏温润之色，杖正持重，不循权宜之计，是以群下不甚附之。”
每当群臣集会，王允很少像以前那样和大家推心置腹，共同商讨权宜之计，而是正襟危坐，面无和悦之色。
慢慢地，群臣也不再像以前那样推崇和拥护他了。
蔡邕曾是董卓的旧臣，当听到董卓被杀的消息时，蔡邕在座上不禁脸色大变，不由自主地发出一声叹息。
王允勃然大怒，严厉指责蔡邕：“董卓是国家的罪人，杀害主上的残臣，为天地所不佑，人神所共疾。
你身为天子臣民，应该从大局考虑，从国家出发，共同声讨国贼，不想你念及他对你的一点私人恩惠，竟然为他感到痛惜，这难道不是与董卓同一鼻孔出气吗？”
说完，便不容分辩，立即将蔡邕押至廷尉处问罪。蔡邕有口难辩，但作为文学家和史官，他为了完成自己未完成的事业，继续写成汉史，便陈辞谢罪，自己愿意承受刺剑削足的酷刑以保全余生。
士大夫们都十分同情怜悯蔡邕的遭遇，设法营救蔡邕，可毫无结果，
太尉马日磾专程前往王允住处，替蔡邕说情：“伯喈（蔡邕字）是难得的旷世奇才，学问渊博，见多识广，特别是对本朝故事了解颇多，应当给他机会，让他继续写成史书，成为一代大典；
况且伯喈以忠孝闻名于士大夫之中，现在以莫须有之名给他判罪，恐怕有失众望，不服人心吧！”
王允根本不听劝告，反驳马日磾说：“先前汉武帝不杀司马迁，让他写成谤书，流传后世，现在国事衰败，社会上缺乏时代精神，不能让佞臣拿着笔在幼主的身边，因为这既对神圣的道德教化毫无益处，而且还使我们这些人遭到批评和指责！”
马日磾无奈，只得退出，感慨地对别人说：“王公这种做法恐怕不行吧！善待人才，这是一个国家得以维持和发展的命脉，而让国家经典得以流传，则是重视国家制度和创作的保障。
如今，这样不重视贤才，切断国家的命脉，阻碍国家经典的流传，难道能维持久远吗？”
当时多数名士都为蔡邕说话，王允这才后悔，打算停手，但蔡邕已经死在了狱中。
董卓死后，王允在如何安排和处理