黄梧的叛变，其危害要远远超过施郎的叛变，对东南抗清事业起到巨大的破坏作用。鉴于黄梧的\"功勋”，清廷授他\"海澄公\"的爵位，黄梧凭借其对郑军底细的了解，竟然恶毒地向清廷献上所谓的\"平海五策”，这\"平海五策\"是：
迁徒沿海居民于内地，距海三十里，不令居住。
郑氏祖坟风水甚美，当令发掘。
郑氏有五大商，在京师、苏、杭、山东等处，经营财货，以济其用，当察出收拿。
郑氏虽居海中，而其田产财贿，皆在漳泉等处，当察出收官。
造八桨小船数十只，无风时出海以取厦门，四面环攻，令彼疲于奔命。
如果说黄梧出于自保而降清，实为无奈之举，此尚有情可缘，可是他居然当起清廷的鹰犬，设计出如此歹毒之阴谋，实令人发指。清顺治帝除了没有采纳第一条建议之外，其余四条全部采纳，对郑家祖挖墓剖棺。影响更大的是郑成功的海上贸易，郑成功虽然偏居一隅，但他仍然是东亚最大的海商，这主要是因为他建立起几条秘密的商业渠道，这些渠道甚至有都城北京，还有苏州、杭州等重要大城市，这岂不令清廷深感震惊，虽然黄梧并这些渠道具体情况并不太了解，但是仍然对郑成功在国内的商业贸易形成空前的打击。
与郑成功相比，黄梧的所作所为更为恶毒，这导致郑、黄两家的仇恨数十年不能消解，十九年后，郑成功的儿子郑经再夺海澄后，黄梧的儿子黄芳度投井而死，郑经砍下黄芳度的脑袋悬挂于竹竿示众，并将剖开黄梧的棺材，戳尸斩首，以解心头之恨。
郑成功是一个非常坚强的人，而且自信得几近偏执，几乎没有任何事情足以挫伤他的自信，但是黄梧的叛变，对他是一生中最大的挫伤，他可能第一次显得不那么自负了，他怀疑了，他的自信动摇了，他产生了问题：“后将何如用人也？”
如何用人，这确实是太难解答的问题了。
是他治军严苛之过吗？也许是，但郑成功可能不这么认为，如果他足够严苛，黄梧的脑袋早就搬家了，还能叛变吗？
黄梧的叛变，不仅是丢了一座城，丢了大量的物资，提出了平海五策，还有一点非常重要，