影片的故事背景设定在高谭市，这座曾经饱受犯罪和混乱困扰的城市，在经历了蝙蝠侠与小丑的对决之后，逐渐走向和平。然而，这份短暂的安宁并未持续太久。贝恩，一个来自神秘组织的恐怖分子，突然出现在高谭市，他不仅带来了毁灭性的武器，还揭示了城市中隐藏的腐败与不公。贝恩的到来彻底打破了高谭市的平静，将整个城市重新推入混乱与恐惧之中。
布鲁斯·韦恩，这位曾经的黑暗骑士，因过去的伤痛与疲惫，已经远离了蝙蝠侠的身份。他在过去的八年里一直隐居，试图摆脱那段充满痛苦的记忆。然而，贝恩的出现让他无法再袖手旁观。面对高谭市再次陷入的危机，韦恩深知自己必须重披战袍，再次成为那个守护城市的暗夜英雄。
贝恩并非只是一个普通的反派，他是一个具有高度智慧和强大体魄的对手。他的真实身份是米拉克尔博士，曾是一名科学家，后来因实验失败而变得面目全非。贝恩通过一种名为“毒液”的药物增强了自身的力量，并组建了一支忠诚于自己的军队。他的目标不仅仅是控制高谭市，更是要揭露这座城市背后的黑暗真相，引发一场社会革命。
随着剧情的发展，蝙蝠侠与贝恩之间的对抗愈发激烈。贝恩不仅攻击了高谭市的基础设施，还利用媒体和公众舆论来制造恐慌。他公开宣称要让高谭市的人民为他们的罪行付出代价，并煽动了一场大规模的暴乱。在这场混乱中，许多无辜的人成为了牺牲品，城市的秩序荡然无存。
与此同时，蝙蝠侠也在寻找应对这场危机的方法。他不仅要面对贝恩的强大攻势，还要处理来自内部的背叛与质疑。警察局长戈登虽然依旧相信蝙蝠侠的存在，但其他政府官员和市民却对他的归来表示怀疑。甚至有人认为，蝙蝠侠的出现只会加剧混乱，而不是解决问题。
为了应对贝恩的威胁，蝙蝠侠不得不寻求新的盟友。他找到了猫女塞尔玛·凯尔，一个聪明且狡猾的