简而言之两派分歧之一是对孔子的态度，古派认为孔子是收集者，复述者扮演导师的角色，其言行可以研究思辨但教义不容置疑，具强烈的排他性，独断性，自大且有宗教化趋势；
今派认为孔子圣人，圣人登霄初步具备神性，将孔子拔高与世俗分离，差别就在这里，中国人对神只充满了实用主义，上午信财神中午就改拜灶王爷，天上神仙千百个孔子算老几，这样就将儒家经典变成同诸子百家一样的普通学术，儒家经典可以改变引申甚至更新重立。
分歧之二是对经文典章的理解，古派主张训诂，对经典咬文嚼字引申注解；今派注重章句，引申注解必须结合文献的背景和写作结构进行逻辑思辨，这个分歧导致双方对于经典文献的解释截然不同。
两个根本矛盾久而久之，造成不可调和的冲突，仗着胆子胡说有一点儿类似天主教与新教的关系。老师有言在先此生只有你们三个徒弟，今派仅存师徒四人，学不好就是犯罪。
先是开宗鼻祖李固遭梁翼迫害被杀，门生故吏牵连颇多，今派遭受第一次打击；其后两次党固再次遭受沉重打击，至今已然没落只余应劭一家传承苟延，这也是袁绍放心把刘琰交给应劭的原因。
初级课程主要是五经，即《诗经》《尚书》《礼记》《周易》《春秋》，刘琰除了《诗经》 其余学得一塌糊涂，学不好就挨打，每次观摩挨揍应璩小脸煞白跟着打哆嗦。
进阶课程包括《论语》《孟子》《老子》，今派《十三经注疏正义》，最重要的是李固着作《德行》，里面表章奏议、对策、教令、记铭林林总总十一篇。
要命的不在课本，今派要求活学活用，不光要展开申论，专题型，论辩型，综叙型，综合型各类论文没完没了，应劭根据不同学习阶段要求学生写成果论文，自己懒得写竟然要求学生写，不满意还连打带损，就没见过这样丧心病狂的老师。
学完这些才算入门，秘传家学自此开始，汝南应氏主攻法学，可不是简单学习法律条文，一本《春秋断狱》作纲，《律疏》《律记》《刑明解释》做辅助，通过逻辑文化研究理论，从制度层面剖析