就在武斗岛，藤树要跑去冲浪 没有跟小智进行道馆对战。
火箭队出来搞事情，却被小智打飞，因此助攻了小智，藤树改变主意，接受了小智的对战请求。
？
又是火箭队三人组的助攻！
一路看过来，火箭队三人组真的是不知不觉中帮助了小智很多次，虽然本意是捕捉皮卡丘。
可惜小智太轻敌，认为藤树沉迷于冲浪，实力应该不强。但事实上，藤树很擅长将冲浪的技术运用在战斗上，他的腕力，幕下力士也很强，小智完全不是对手。
至此，小智派出的两只宝可梦全都被打败。
【希巴：藤树还是那么强，专门宝可梦冲浪，遇到攻击的时候跟冲浪时遇到大浪身体保持稳定的动作是一样的。】
【藤树：险胜而已，后面小智锻炼之后就赢了，他是成长型的天才训练家。】
而小智被打败之后，就在武斗岛进行修炼，途中听说了大吾来到了石之洞窟，
因为火箭队三人组挖陷阱的缘故，小智一行人和他们一起掉进了洞穴的最深处 还惹到了可可多拉群，刚好被大吾派出波士可多拉救下，然后将火箭队三人组打飞了，大吾很幸运地发现了火之石。
【御龙渡：跑这么远就来找火之石】
大吾对石头的热爱无法想象。
【米可利：石头狂就是这样的，大吾对石头很感兴趣的，甚至自己的宝可梦基本上都是岩石系的。】
小智带着自己的宝可梦在海边进行特训，突然从帐篷旁出现了一个不明物体，搞出了许多幺蛾子出来，后面发现是龙虾小兵。
一眼就看上了龙虾小兵 小智派出木守宫跟它对战，成功收服了龙虾小兵。
小刚也在武斗岛锻炼的时候收服了一只水跃鱼。
不久后，还遇到了小田卷博士，小智一行人就跟小田卷博士研究洞窟得生态，发现了一个人工制造出来的小屋，另外熔岩队也进入了这个小屋，进入了一个遗迹，海洋队也在这里，双方都在遗迹上做了些检测就离开。
途中就听说到了红色珠子、蓝色珠子之类的。
【大吾：那俩队是想用两个宝石来操控创造海洋和陆地的神兽，一方要扩张大地，一方