早在张宏范率军到来前，肥后藩主见刘复亨的前锋只有3000人左右，而且都是从赤坂城血战出来的，几乎人人带伤，这藩主见了，动了歪心，集结了4000藩兵和6000足轻，想上去劫掠一番，同时也抢点功劳。
怎料，这3000人是刘复亨派出来准备绕到大宰府后面发起攻击的，一见这些倭兵，以为是从大宰府突围跑出来的，赶紧上前，猛烈攻击，结果，几乎很少打仗的肥后藩的藩兵和足轻，被只有自己兵力三分之一的元军杀得哭爹喊娘，满山逃命。
随后，大宰府被攻克的消息传来，肥后藩的藩主惊恐万状，已经作好了万一元军大军来攻，马上逃往日向，下一步再越濑户内海逃往四国也有可能。
但是，元军并没有乘胜向南九州发起攻击的打算，地形复杂、兵力有限，而且在几天几夜的搏杀中，登陆博多、对拼藤原、攻占大宰府，刘复亨部伤亡达余人，早已失去了进攻能力，而且伯颜并未要求攻占南九州，拿下大宰府，可以说已经完成了使命。
现在，刘复亨所部5万兵力，仅剩余人，刘复亨奉伯颜之命，率大部分将士沿八重岳和神代浮桥展开，主要防守力量都集结在肥后藩的地盘上。
史柱率领7000原水师的部队继续驻扎在大船上，不过因为飓风季节到来的原因，这部分水师和大船基本都驻扎在沿海的避风港口（大部分船只已经交给范文虎在飓风来临之前驶回了中国江南）。
乞哥到来后，水师将加强到人，虽然未必有什么绝对优势，但是在天皇的水师驻扎在东海岸，不愿和幕府水师联合的情况下，还是能够大致保证本州沿海地带的制海权的。
伯颜很快就得到了忻都和洪茶丘的战报，知道他们已经跟幕府军的主力对决过了，由于兵力劣势和地形不利，决战失利，金方庆重伤，虽然治好了，但是右手和左腿却失去了，如今只能在帐中共同商幄军机，但不能再上前线指挥。
不过幕府方面应该也受到了很大的损失，根据战报，伯颜认为石田等人至少损失了一半的兵力，其实，伯颜还是高估了幕府，在1个多月的作战中，石田和新兵卫等