回到青青草原后，喜羊羊他们本以为能过上平静的日子。可不久后，一封神秘信件打破了这份宁静。信上说，四季城虽已恢复安宁，但邪恶意志并未完全消散，在遥远的神秘之境又出现了新的黑暗迹象，且与之前的邪恶意志有所关联。
伙伴们毫不犹豫，再次踏上新的冒险之旅。他们来到神秘之境，这里环境诡异，危机四伏。刚进入不久，就遇到了各种奇特的魔法陷阱和强大的神秘生物阻拦。在一次激烈战斗中，灰太狼不小心被敌人的魔法击中，陷入了昏迷。伙伴们心急如焚，一边保护灰太狼，一边寻找破解困境的办法。
喜羊羊发现神秘之境的力量与四季城的元素似乎存在某种联系，他凭借着之前勇闯四季城的经验，结合大家的能力，巧妙地化解了一个又一个危机。他们能否再次凭借爱与勇气，彻底消除黑暗力量，让世界重归和平？一切还是未知。
就在大家为解救灰太狼一筹莫展时，一只神秘的小精灵突然出现。它自称知晓解救灰太狼的办法，但需要大家帮它完成一个任务——找回被黑暗力量夺走的神秘之境的核心宝石。伙伴们为了救灰太狼，毅然答应。他们跟随小精灵的指引，穿过阴森的魔法森林，跨过湍急的毒液河流，终于找到了藏有核心宝石的洞穴。然而，洞穴中守护宝石的是一只巨大的机械兽，它火力强大，让伙伴们难以近身。喜羊羊观察机械兽的攻击模式，发现其弱点所在，指挥大家集中攻击。经过一番苦战，他们成功击败机械兽，夺回核心宝石。小精灵用宝石的力量治好了灰太狼。此时，黑暗力量察觉到他们的行动，派出更强大的黑暗军团前来