在很长一段时间内，一些人类都不得不在黑暗的宇宙中，像一座座孤岛一样孤独的活着，甚至进化出了很多分支，不再认同宇宙人类的身份，
这给宇宙人类的发展带来了重重障碍，甚至还引发了一场巨大的危机，这也是所谓的“黑暗时代”名字的由来。
在动乱期间到底发生了什么，因为时间太过久远，已经不可考，但结果是稍后的时期，宇宙人类中出现了一位雄才大略的人物，
他屠灭了少数顽固不化，拒绝合作的人类分支，统合了并建立了“银河联邦”
并以当时最为强大的十二位灵能使，建立了对十二圣宫，指挥着宇宙人类的星际战士军团向四方开拓征服。
为了防止之前同室操戈的悲剧再次发生，十二圣宫在向外开拓领土的时候，都会在适当的星球建造星炬，
就这样，在十二圣宫和最高议会的二元制政体下，在持续的大远征中，宇宙人类使用强大的灵能，开始了征服之旅。
在第一位突破圣座极限，达到帝皇级的宇宙人类出现之后，宇宙人类就突破了四维，来到了源宇宙，慢慢成长到可以参与诸天争霸的超强种族。