大家都意识到，神秘组织背后必有更深的势力支持。就在众人讨论对策时，暗部来报，村子周边出现了一些奇怪的迹象，像是有未知的查克拉波动。水门决定亲自带领小队前去探查。他们来到一处山谷，这里弥漫着一股压抑的气息。突然，地面裂开，一群长相怪异的傀儡从地下涌出，这些傀儡动作敏捷，攻击犀利。水门等人陷入了苦战，就在他们有些力不从心时，神秘组织首领竟再次出现，他虽然还带着伤，但眼神中透露出疯狂。原来，他在之前的战斗中故意示弱，就是为了引出水门等人。首领操控着傀儡将他们团团围住，得意地大笑，声称这一次不会再让水门破坏他们的计划。而此时，那未知的查克拉波动愈发强烈，一场新的危机正悄然降临。 就在水门等人被傀儡逼入绝境之时，那未知查克拉波动的源头终于显现——竟是一群神秘的幽灵忍者。他们周身散发着幽绿光芒，行动飘忽不定，一出现便与神秘组织首领联手，对水门小队发起更猛烈的攻击。水门心中一惊，没想到神秘组织背后还有这等势力。
但他很快镇定下来，指挥小队成员相互配合，寻找破敌之法。就在战斗陷入胶着时，水门突然发现幽灵忍者与傀儡之间存在一种微妙的能量联系。他当机立断，施展飞雷神之术，切断了部分能量连接，傀儡的动作瞬间迟缓。趁此机会，小队成员合力攻击首领，首领虽带伤抵抗，但渐渐力不从心。而幽灵忍者失去傀儡配合，威力大减。就在水门准备给予首领致命一击时，神秘组织竟启动了山谷中的神秘机关，一道巨大的能量屏障升起，将他们困在其中，一场新的考验又摆在了水门面前。 水门看着这突然出现的能量屏障，眉头紧锁。屏障内，幽灵忍者和残余的傀儡再次发起攻击，小队成员们只能边战边寻找破障之法。水门集中精神感知屏障，发现它竟与山谷下的古老符文相连。他当机立断，让队友们牵制敌人，自己则施展飞雷神潜入地下。在阴暗潮湿的地下，水门找到了符文阵的核心。他双手结印，释放出强大的查克拉冲击核心。
与此同时，地面上的队友们也奋力抵抗，为水门争取时间。就