永嘉七年（313年），晋怀帝被杀，司马邺继位，是为晋愍帝，并升张轨为司空，张轨坚辞不受。太府参军索辅向张轨进言道：“从前用金贝皮币作买卖货币，消除了用粮食布帛度量交换的损耗。两汉制造五铢钱，贸易流通不息。泰始年间（265年―274年），河西地区荒废不堪，便不再使用钱币，割布分段来计钱数。绢布既被毁坏，交易起来又困难，只会徒然破坏女工的作业，使布帛不能制作衣服，实为严重的弊病。如今中州虽战乱不休，但凉州安定，应恢复使用五铢钱以畅通买卖贸易。”张轨采纳这一建议，建立制度，以布帛为标准，用钱交易，钱币便大为流行，凉州百姓获得便利。同时，刘曜寇犯北地，进逼长安，张轨又派参军麹陶率三千人马保卫京都长安。
建兴二年（314年），晋愍帝派大鸿胪辛攀拜张轨为侍中、太尉、凉州牧、西平公，张轨又坚决辞谢。
因病去世
建兴二年（314年）五月，张轨卧病不起，临终前留下遗言道：“我平生对他人无甚恩惠，今日疾病垂危，大概命将告终了。我死后，文武将佐都应尽忠尽义，务必安抚百姓，上报国家，下安家室。我死后以普通棺木从简安葬，墓中不藏金玉。好好辅助我儿安逊（张寔的字），听从朝廷旨意。”上表朝廷请求立其子张寔为世子。五月己丑日，张轨去世，终年六十，葬于建陵，朝廷追赠侍中、太尉，谥号为武公16
（《十六国春秋》、《资治通鉴》皆作武穆公）。张轨的亲信部下及后拥立张轨长子张寔继任了凉州牧之职。曾孙张祚僭号，追谥为武王，庙号太祖。17
人物评价
司马邺：“惟尔凉州刺史张轨，乃心王室，旌旗连络万里星赴，进次秦陇，便当协力济难，恢复神州。”
房玄龄等《晋书》：“周公保之而立功，士彦拥之布延世。挚虞观象，记洪灾之不流；侯瑾觇泉，知霸者之斯在。匪唯地势，抑亦有天道歙！”；2“三象构氛，九土瓜分。鼎迁江介，地