欧阳轩同时给海军下达了决战命令。密令先是通过快马和信鸽到达交趾，再由快船分别送往琼州、流求和济州三岛。虽然信件到达三地时间会在二十天甚至二十天之后，但并不贻误战机。眼下元军虽然已大规模过江，但主力仍在江北。欧阳轩下达的命令是，元军大部分渡江之后，东海舰队与南海舰队再进入长江，并溯水而上，控制峡州至出海口的航道。至于出兵时间，则由黄大根相机决定。在长江航道畅通之前，欧阳轩授命黄大根全权指挥海军的战事。
济州岛的海军陆战军将在两支舰队封锁长江航道之后，在北海舰队的掩护下，在一个叫直沽寨的地方登陆。此处地势平坦又有深水良港，适合大规模船只停靠，且距离元大都不到三百里地，它在后世还有一个鼎鼎大名——天津。欧阳轩选择这个地方登陆还有一个重要的原因是，此处入海口还有条水量流沛的大河，可以运输粮草辎重，特别是可以将大炮运输到距元大都不足百里的地方。按照欧阳轩命令，在陆战军在直沽寨登陆的同时，北海舰队的陆战团也将在淮东的涟、海两州登陆，并与在淮东活动的张贵等义军取得联系。
决战命令传到遥远的库页城之时，将会是数月之后。眼下正是二月，鲜卑利亚正是冰封的冬日，不仅黑龙江封冻，连库页城周边海域也不能行船。只有等海冰融化，黑龙江水重新流淌，命令才能溯水而上，到达沿岸的黑龙堡、伯力城、抚远城。当钱虎召集齐混成旅的人马向南出发，再快也是六月份之后了。这个时间也是总参谋部认为最适合的时间，除了酷寒不利于战事，也是因为如果过早动手，蒙元必然会调集大军前去解决这个来自后背的隐患。当元军主力